Skóladagur nemenda í 1. – 4.bekk
| 08:00 | Skólinn opnaður |
| 08:10 – 9:30 | Kennsla hefst – vinnulota |
| 09:30 – 9:50 | Morgunhressing |
| 09:50 – 10:10 | Útivist |
| 10:10 – 11:10 | Vinnulota |
| 11:30 – 11:50 | Matur og útivist |
| 11:50 – 12:10 | Matur og útivist |
| 12:00 – 13:20 | Vinnulota |
| 13:20 – 17:00 | Frístund |
Skóladagur nemenda í 5. – 7.bekk
| 08:00 | Skólinn opnaður |
| 8:10 – 9:30 | Kennsla hefst – vinnulota |
| 9:30 – 9:50 | Útivist |
| 9:50 – 10:10 | Morgunhressing |
| 10:10 – 11:10 | Vinnulota |
| 11:10 – 11:30 | Matur / vinnulota |
| 11:30 – 12:00 | Útivist |
| 12:00 – 12:20 | Vinnulota / matur |
| 12:20 – 14:00 | Vinnulota |
Skóladagur nemenda í 8. – 10. bekk
| 08:00 | Skólinn opnaður |
| 8:30 – 9:30 | Vinnulota |
| 9:30 – 9:50 | Frímínútur – nesti |
| 9:50 -10:50 | Vinnulota |
| 10:50 – 11:00 | Frímínútur |
| 11:00 – 12:00 | Vinnulota (ýmist í 40 eða 60 mínútur) |
| 12:40 – 13:10 | Frímínútur – matur |
| 13:10 – 13:50/14:10 | Vinnulota (ýmist í 40 eða 60 mínútur) |
| 13:50 – 14:30/40 | Vinnulota |
| 14:10/40 – 15:30/15:50/16:10 | Vinnulota – Kennsla valgreina |
Skólaárið
Skólaárinu í Vatnsendaskóla er skipt upp í tvær annir.
Vikulegur kennslustundafjöldi í hverjum árgangi:
1. – 4. bekkur 30 stundir
5. – 7. bekkur 35 stundir
8.- 10. bekkur 37 stundir